Pertama buatlah copy profil di Firefox 2 dengan cara menjalankan peritnah ini dari command line
/path/to/firefox -profilemanager -no-remote
Setelah muncul windows, buat profil baru.

Kedua, install Firefox 3 dengan menggunakan directory yang berbeda dengan Firefox 2.

Terakhir, buat shortcut agar Firefox 3 menggunakan profil yang dibuat di langkah pertama.
/path/to/firefox3 -P namaprofilbaru -no-remote

Dan sekarang kedua versi Firefox bisa berjalan bersamaan.